En octobre 2010, Solthis a dû fermer son programme au Burundi mis en place en mars 2009. En effet, les demandes d'agrément déposées depuis plusieurs mois pour deux des postes essentiels au fonctionnement de son programme – Chef de mission et Coordinateur médical – n'ont pas été approuvées. Devant l'impossibilité de dialoguer avec les autorités en charge du dossier, Solthis s'est trouvée dans l'obligation de mettre un terme à ses activités au Burundi.

Solthis regrette cette situation, d'autant plus que l'ensemble des partenariats techniques et de coopération noués depuis la première mission exploratoire en février 2008 avec les acteurs impliqués dans la lutte contre le VIH s'étaient révélés fructueux ; et que les besoins en matière de prise en charge du VIH au Burundi demeurent importants (la couverture des besoins en ARV est seulement de 19 % selon le dernier rapport de l'ONUSIDA-OMS-UNICEF, Towards Universal Access Scaling up priority HIV/ AIDS interventions in the health sector, de septembre 2010).

Solthis laisse derrière elle un important travail et un fort investissement, et une équipe nationale qui a toujours été d'un soutien sans faille. Cette décision de fermeture de son programme a été particulièrement difficile à prendre et n'a pu être envisagée qu'après avoir épuisé tous les recours.