Sous la responsabilité directe du Directeur des opérations au siège, le Chef de mission est responsable du bon déroulement du programme dans le pays. Il a la responsabilité de l'encadrement de l'équipe.

Son rôle est de définir, de planifier et de suivre le programme, d'en définir les moyens humains et matériels avec son équipe et le siège. Il est le représentant de SOLTHIS vis à vis des différentes autorités nationales, internationales et des partenaires locaux .

Il définit et planifie les aspects médicaux du programme et en fixe les objectifs sous la responsabilité du Directeur médical au siège et du Chef de mission.

Spécialisé en maladies infectieuses et dans la prise en charge du VIH/Sida (si possible dans le contexte PVD), iI appuie les acteurs nationaux au niveau central (aide à la rédaction des normes et procédures / aide à la décision au niveau des politiques de santé en matière de VIH...) et accompagne les équipes médicales dans les structures partenaires locales. Il veille au recueil et à l'analyse des données épidémiologiques des patients suivis dans le cadre des programmes nationaux de prise en charge.

Sous la responsabilité directe du Responsable administratif et financier au siège et du Chef de mission, il définit et organise les activités logistiques du programme. Il peut également en lien avec le Responsable pharmacie au siège, venir en appui pour les approvisionnements en médicaments et les réactifs.

 Il est  responsable de la gestion financière et sociale du programme. Il est le garant de la politique financière de SOLTHIS sur le terrain et mesure la bonne adéquation entre les moyens financiers et les activités. Il organise le séjour des expatriés du point de vue administratif et supervise les ressources humaines du personnel national.